Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPARGC1AQ9UBK2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms