Protein–RNA interactions for Protein: Q9P270

SLAIN2, SLAIN motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAIN2Q9P270 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLAIN2Q9P270 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLAIN2Q9P270 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLAIN2Q9P270 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLAIN2Q9P270 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLAIN2Q9P270 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLAIN2Q9P270 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLAIN2Q9P270 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLAIN2Q9P270 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLAIN2Q9P270 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLAIN2Q9P270 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLAIN2Q9P270 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLAIN2Q9P270 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLAIN2Q9P270 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLAIN2Q9P270 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLAIN2Q9P270 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLAIN2Q9P270 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms