Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC180Q9P1Z9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms