Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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