Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GDE1Q9NZC3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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