Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms