Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT57Q9NWB7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms