Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms