Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SEMA4BQ9NPR2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms