Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMG20AQ9NP66 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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