Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms