Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSPNQ9HAW4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms