Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C11orf49Q9H6J7 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms