Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms