Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF17Q9BXT8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF17Q9BXT8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms