Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPATA9Q9BWV2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms