Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms