Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM43Q9BTV4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms