Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PI4K2AQ9BTU6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms