Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA1CQ9BQE3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA1CQ9BQE3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms