Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms