Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC9Q96Q05 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms