Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5RAP3Q96JB5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms