Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00526Q96FQ7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms