Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms