Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
NCSTNQ92542 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCSTNQ92542 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms