Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms