Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT5

NEIL3, Endonuclease 8-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL3Q8TAT5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL3Q8TAT5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL3Q8TAT5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms