Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD1Q8NHV4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms