Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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ZNF248Q8NDW4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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ZNF248Q8NDW4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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ZNF248Q8NDW4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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ZNF248Q8NDW4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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ZNF248Q8NDW4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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ZNF248Q8NDW4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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