Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZIC4Q8N9L1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms