Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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TMCO5AQ8N6Q1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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TMCO5AQ8N6Q1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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TMCO5AQ8N6Q1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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TMCO5AQ8N6Q1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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TMCO5AQ8N6Q1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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TMCO5AQ8N6Q1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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TMCO5AQ8N6Q1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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TMCO5AQ8N6Q1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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TMCO5AQ8N6Q1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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TMCO5AQ8N6Q1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMCO5AQ8N6Q1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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