Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTROBQ8N137 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTROBQ8N137 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms