Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf40Q8IXQ3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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