Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMB4Q86W47 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms