Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
WDR53Q7Z5U6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms