Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms