Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP34Q70CQ2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms