Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBR1LQ6UX01 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms