Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSSK4Q6SA08 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSSK4Q6SA08 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms