Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZBED9Q6R2W3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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