Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC27A4Q6P1M0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms