Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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FAM208BQ5VWN6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM208BQ5VWN6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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FAM208BQ5VWN6 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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FAM208BQ5VWN6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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FAM208BQ5VWN6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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FAM208BQ5VWN6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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FAM208BQ5VWN6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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