Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf140Q5VVS0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf140Q5VVS0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms