Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms