Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AKR1C8P-201ENST00000578467 2182 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ANKRD39Q53RE8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms