Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN2Q52LD8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms