Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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GEN1Q17RS7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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GEN1Q17RS7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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