Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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NDUFA9Q16795 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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NDUFA9Q16795 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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NDUFA9Q16795 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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NDUFA9Q16795 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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NDUFA9Q16795 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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NDUFA9Q16795 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NDUFA9Q16795 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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