Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SGCAQ16586 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCAQ16586 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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